Качествена оценка на педигрето на Среднородопската овца 2005-2023
Живко Дучев
, Павел Тодоров
Abstract: Целта на настоящото изследване беше да се оцени качеството на родословната информация на Среднородопската овца, в периода 2005-2023. За целта бяха използвани данните от родословната книга на породата, водена от Асоциация за развъждане на Среднородопска, Каракачанска и Родопски цигай овце, в която за изследвания период са регистрирани 18 720 записа. Заедно със записаните само като бащи и майки животни в педигре файла, общо бяха събрани 22 686 индивида. Педигрето беше обработено със софтуерня пакет OptiSel и проверено за грешки с програмата PedigreeViewer, като всички цикли и несъответствия в пола бяха разрешени, чрез изтриване на конфликтните данни. Общо във файла има идентифицирани 565 бащи и 12 156 майки. Най-дългото проследено педигре на животно е с 6 пояса. След 2014 година, индексът за пълнота на педигрето е над 98% за първи пояс, а за втори и трети нараства съответно от 58% до 100% и от 38% до 94%. За последните 5 години средния брой еквивалентни пояси по години на раждане е между 2.145 и 3.159, а броят пълни пояси 1.839 – 2.537. От резултатите следва, че събраните до сега данни в педигрето биха могли да бъдат използвани за анализ на структурата на популацията и генетичното разнообразие на породата Среднородопска овца.
Keywords: пълнота; родословна книга; местна порода
Citation: Duchev, Zh. & Todorov, P. (2024). Estimation of the Central Rhodope Sheep pedigree quality in 2005-2023. Bulgarian Journal of Animal Husbandry, 61(2), 15-21 (Bg).
| References: (click to open/close) | Justinski, C., Wilkens, J. & Distl, O. (2023). Genetic Diversity and Trends of Ancestral and New Inbreeding in German Sheep Breeds by Pedigree Data. Animals, 13(4), 623. https://doi.org/10.3390/ani13040623.
Kasap, A., Ramljak, J. & Špehar, M. (2021). Estimation of Population-Specific Genetic Parameters Important for Long-Term Optimum Contribution Selection—Case Study on a Dairy Istrian Sheep Breed. Animals, 11, 2356. https://doi.org/10.3390/ani11082356.
Kinghorn, B. P. (2011). An algorithm for efficient constrained mate selection. Genetics Selection Evolution, 43(1). https://doi.org/10.1186/1297-9686-43-4.
MacCluer, J. W., Boyce, A. J., Dyke, B., Weitkamp, L. R., Pfennig, D. W. & Parsons, C. J. (1983). Inbreeding and pedigree structure in Standardbred horses. Journal of Heredity, 74, 394–399. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a109824.
Maignel, L., Boichard, D. & Verrier, E. (1996). Genetic variability of French dairy breeds estimated from pedigree information. Interbull Bulletin, 14, 49–54.
Nilson, S. M., Burke, J. M., Murdoch, B. M., Morgan, J. L. M. & Lewis, R. M. (2023). Pedigree diversity and implications for genetic selection of Katahdin sheep. Journal of Animal Breeding and Genetics. https://doi.org/10.1111/jbg.12842.
Oliehoek, P. A. & Bijma, P. (2009). Effects of pedigree errors on the efficiency of conservation decisions. Genetics Selection Evolution, 41(9).https://doi.org/10.1186/1297-9686-41-9.
R Core Team (2021). R: A language and environment for statistical computing. Vienna: R Foundation for Statistical Computing. https://www.R-project.org/.
Vyas, J., Chopra, A., Pannu, U., Saran, R. K. & Narula, H. K. (2022). Population structure of Marwari sheep through pedigree analysis. Small Ruminant Research, 206, 106590. https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2021.106590.
Wellmann, R. (2019). Optimum contribution selection for animal breeding and conservation: the R package optiSel. BMC Bioinformatics, 20, 25. https://doi.org/10.1186/s12859-018-2450-5.
Cortellari, M., Negro, A., Bionda, A., Grande, S., Cesarani, A., Carta, A., Macciotta, N., Biffani, S. & Crepaldi, P. (2022). Using Pedigree and Genomic Data toward Better Management of Inbreeding in Italian Dairy Sheep and Goat Breeds. Animals, 12(20), 2828. https://doi.org/10.3390/ani12202828.
Zhelyazkova, P., Dimov, D. & Andonov, S. (2023). Genetic-parameter estimation of milk yield in White Maritza sheep breed using different test day models. Archives Animal Breeding, 66(3), 253-263. https://doi.org/10.5194/aab-66-253-2023.
|
|
| Date published: 2024-04-30
Download full text 
