Генетичен полиморфизъм на мелатонин-рецепторния (MTNR1A) ген в популации на местни породи овце

Деяна Генчева

Abstract: В настоящото проучване е изследван единичният нуклеотиден полиморфизъм (SNP) в екзон II на мелатонин-рецепторния ген (MTNR1A) при общо 177 индивида от четири автохтонни породи овце: Медночервена шуменска, Каракачанска, Черноглава плевенска и Софийска (Елинпелинска). На базата на PCR-RFLP анализ са идентифицирани двата алела на този ген (C и T) и съответният генотип (CC, CT и TT) на индивидите. Установена е противоположна тенденция в разпределението на честотите на двата алела при овцете от породата Черноглава плевенска (0,694 за алел С и 0,306 за алел Т) и съответно при Медночервена шуменска порода (0,267 за алел С и 0,733 за алел Т). Сходни стойности за алелните честоти по проучвания ген са отчетени за породите Каракачанска (0,589 и 0,411) и Софийска (0,605 и 0,395). Нивото на генетично разнообразие по отношение на гена MTNR1A е най-високо при Софийската популация овце (Ho = 0,512 и He = 0,483), за която е отчетен нисък коефициент на инбридинг (Fis = -0.070) и съответствие с равновесието по Харди-Вайнберг (P = 0,701). Установено е средно ниво на генетичното разнообразие при овцете от породите Медночервена шуменска, Каракачанска и Черноглава плевенска (He = 0,391, 0,489 и 0,428), както и висок коефициент на инбридинг (Fis = 0,432, 0,495 и 0,258) и отклонение от HWE (P = 0,002, 0,006 и 0,049). Най-високи стойности на генетичните дистанции по Ней са отчетени между породите Медночервена шуменска и Черноглава плевенска (DA = 0,369), а най-ниски - между Каракачанска и Софийска (DA = 0,005). Резултатите, представени в това изследване, ясно показват наличие на полиморфизъм в екзон II на гена MTNR1A при българските автохтонни породи овце и потвърждават значението на този полиморфизъм като потенциален ДНК маркер в маркерната селекция в областта на овцевъдството и съхраняването на генетичното разнообразие в изследваните популации овце.

Keywords: мелатонин-рецепторен ген (MTNR1A); Ovis aries; PCR-RFLP анализ; единичен нуклеотиден полиморфизъм

Date published: 2019-05-09